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亞細胞蛋白質組學(subcellular proteomics)是針對細胞內不同區域結構功能單位的蛋白質組學研究,可以減少全細胞蛋白組分析的復雜性。對亞細胞結構進行功能分析,將定量技術和差異分析引入亞細胞蛋白質組學,來觀察亞細胞結構的蛋白質組在某些生理或病理條件下的變化,可加深對細胞生理分子機制和亞細胞組分結構功能的理解。

武漢金開瑞結合多年蛋白組學研究經驗,已成功實現對多個亞細胞器組分的定性和定量分析,包括膜蛋白質組、葉綠體蛋白質組、線粒體蛋白質組等。

生物膜是細胞的基本結構,在幾乎所有的生命活動中承擔著重要的功能,其功能主要通過膜蛋白實現。膜蛋白的功能異常與多種疾病直接相關,其中50%是目前已知藥物的作用靶點。膜蛋白質組學研究可用于尋找疾病標志物,篩選藥物作用靶點等。

葉綠體是植物進行光合作用的主要場所,是除細胞核外存在遺傳物質的細胞器之一。葉綠體蛋白質組學對闡明葉綠體在植物生長發育及代謝調控等生命活動中的規律等方面具有重要意義。

線粒體是細胞能量代謝、生物合成 和細胞死亡的調控中心,其蛋白結構和功能的改變會導致許多疾病的產生。線粒體蛋白質組學研究可為解析線粒體的生理功能、探索線粒體相關疾病的發病機制及促進線粒體為靶向的藥物研發提供重要理論依據。

外泌體是一種微分泌囊泡,是細胞 內囊泡轉運的產物之一,在抗原呈遞、腫瘤的生長與遷移、組織損傷的修復等生理病理過程中起著重要的作用。外泌體蛋白質組可促進外泌體本質闡明和臨床應用的進一步研究。

全譜
鑒定

iTRAQ
TMT

SWATH

Label-
free

技術流程
樣本

● 線粒體分離純化
● 葉綠體分離純化
● 細胞膜分離純化

 
亞細胞組分

● 蛋白提取

 
蛋白

● 定量
● SDS-PAGE

 
酶解、除鹽

● Itraq/TMT
● Label-free
● SWATH/DIA
● PRM

 
生信分析

● 定性
● 定量
● 功能注釋
● 差異分析
● 亞細胞定位分析

技術優勢

高穩定蛋白提取方法:在主流提取(膜蛋白/線粒體/葉綠體/外泌體等)技術的基礎上,優化了提取方案的上下游,使提取純度在原有基礎上增加10-20%,蛋白通量增加15%

高性能質譜系統:配備高性能質譜系統和SWATH全掃描采集方式,有效提升了對極低豐度的亞細胞相關蛋白的鑒定

多數據庫整合:通過整合多個相關的高質量蛋白數據庫,極大提高亞細胞蛋白定位準確度和通量

多維度數據分析:鑒定蛋白除了與更全的相關亞細胞數據庫比較外,同時基于計算方法,使用多款軟件進行亞細胞定位預測分析,進一步增加鑒定通量。


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