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SWATH定量蛋白質組學

服務簡介

SWATH(Sequential Window Acquisition of all THeoretical Mass Spectra)是瑞士蘇黎世聯邦理工學院的Ruedi Aebersold 博士及其團隊與AB-SCIEX聯合推出的一項全新的質譜技術。SWATH采集模式將掃描范圍劃分為以25 Da為間隔的一系列區間,通過超高速掃描來獲得掃描范圍內全部離子的所有碎片信息,是 MS/MSALL技術的擴展。SWATH技術是一種真正全景式的、高通量的質譜技術,同時也大大提高了定量的可重現性。

技術特點

靈敏度高:SWATH技術利用高分辨率的TripleTOF 5600 +系統,達到了與MRM相當的定量靈敏度;

重復性好:重復樣品間的定量相關性可達到0.99以上;

定量準確度高:定量準確度幾乎與MRM技術相當;

線性動態范圍廣:定量范圍可跨越4個數量級;

通量大:一次實驗可檢測到2000種以上蛋白并定量。

適用范圍

藥物作用靶點研究;

疾病標志物篩選;

植物脅迫/抗逆研究;

作用機制研究;

物種蛋白質草圖構建;

要求物種含有已完成全基因組測序或轉錄組測序注釋的CDS信息。

客戶提供

需鑒定的樣品;

樣品信息單:需詳細填寫樣品來源、含量、狀態及其他基本信息。

最終交付

實驗報告一份,含具體實驗流程及蛋白質組鑒定及定量結果(生物信息學分析)。

生物信息學分析內容包括:

SWATH 參考譜圖數據庫構建:通過DDA模式的掃描結果,譜圖數據庫構建、全譜鑒定及結果可靠性評估;

SWATH定量:根據二級碎片離子的全掃描結果實現二級離子的定量,SWATH結果可靠性分析,差異表達分析,層次聚類,PCA分析等;

蛋白質功能注釋:包括GO注釋、COG分類和KEGG Pathway分析;

差異蛋白功能富集:包括GO富集、Pathway富集;

差異蛋白網絡互作:基于STRING 數據庫的PPI分析,基于Cytoscape的可視化展示。

服務周期

自送樣起45個工作日。

如何訂購

1. 郵件訂購:請點擊此處下載“蛋白質組學項目信息咨詢單”,詳細填寫信息后,發送至郵箱[email protected]

2. 在線咨詢:點擊屏幕右側“在線咨詢”,或撥打咨詢電話027-62431110,我們會盡快安排工作人員與您聯系!

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