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Label-free定量蛋白質組學

服務簡介

Label-free是通過比較質譜分析次數或質譜峰強度,分析不同來源樣品蛋白的數量變化,認為肽段在質譜中被捕獲檢測的頻率與其在混合物中的豐度成正相關。因此,蛋白質被質譜檢測的計數反映了蛋白質的豐度,通過適當的數學公式可以將質譜檢測計數與蛋白質的量聯系起來,從而對蛋白質進行定量。按照其原理主要分為兩種,第一種spectrum counts類的非標記方法,發展比較早,已經形成多種定量算法。但是主要的原理是以MS2的鑒定結果為定量基礎,各種方法的差別在于后期算法在大規模數據上的修正。第二種非標記定量的原理是以MS1為基礎,計算每個肽段的信號強度在LC-MS上的積分。

技術特點

無需標記,操作簡單;

不受比較樣品數限制;

對實驗操作穩定性、重復性要求高;

準確性較標記定量略低;

要求至少做三次技術重復或生物重復。

適用范圍

適合大樣本量的定量比較,對無法用標記定量實現的實驗設計,用Label-free技術;

藥物作用靶點研究;

疾病標志物篩選;

植物脅迫/抗逆研究;

作用機制研究;

物種蛋白質草圖構建;

要求物種含有已完成全基因組測序或轉錄組測序注釋的CDS信息。

服務流程
接受訂單及樣品
 
蛋白酶解
 
HPLC分組分
 
LC-MS/MS
 
數據解析
 
結果交付
客戶提供

需鑒定的樣品;

樣品信息單:需詳細填寫樣品來源、含量、狀態及其他基本信息。

最終交付

實驗報告一份,含具體實驗流程及蛋白質組鑒定及定量結果(生物信息學分析)。

生物信息學分析內容包括:

Label-free定量:包括定量信息統計、蛋白質定量結果及肽段定量統計;

功能注釋:包括GO注釋、COG注釋和Pathway代謝通路注釋;

差異蛋白的富集分析:包括差異蛋白的GO富集分析和差異蛋白的Pathway富集分析。

服務周期

自送樣起45個工作日。

如何訂購

1. 郵件訂購:請點擊此處下載“蛋白質組學項目信息咨詢單”,詳細填寫信息后,發送至郵箱[email protected]

2. 在線咨詢:點擊屏幕右側“在線咨詢”,或撥打咨詢電話027-62431110,我們會盡快安排工作人員與您聯系!

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